В то время как велась кровопролитная борьба между двумя враждующими партиями, другой испанец — Педро де Вальдивия — возобновил покорение Чили, начатое Альмагро. Отправившись из Перу в 1540 г., он с боями достиг реки Мапочо, на берегу которой (к западу от горы Муэлен) основал город Сантьяго (12 февраля 1541 г.), создав для его управления городской совет. Вскоре начались восстания различных местных племен, и в то время как Вальдивия выступил на их усмирение, другие племена напали на новый город, в котором оставался гарнизон всего в 50 человек. Хотя Вальдивии и удалось усмирить восставших, город был разрушен до основания. Вскоре возвратившийся Вальдивия вновь отстроил его, на этот раз уже более капитально.